RNA荧光原位杂交(Fluorescent in situ hybridization,
FISH)是一种分子生物学技术,用于定位细胞或组织中的特定RNA序列。这项技术结合了分子杂交技术和荧光显微镜技术,使得研究人员能够在单细胞水平上可视化特定的RNA分子。
原理
FISH技术基于核酸杂交原理,即互补的DNA或RNA链能够特异性地结合在一起。在FISH实验中,合成的寡核苷酸探针被标记上荧光基团,然后与样本中的RNA分子进行杂交。如果探针与样本中的RNA序列互补,那么它们就会形成稳定的双链结构,从而可以通过荧光显微镜观察到荧光信号。
实验步骤
样本制备:首先需要固定细胞或组织切片,以便于后续的杂交反应。
预杂交处理:包括蛋白酶消化、脱脂、RNA变性等步骤,目的是去除杂质并使RNA分子变得可用。
探针标记与杂交:将标记有荧光基团的RNA探针加入到样本中,让探针与目标RNA杂交。
洗涤:去除未结合的探针。
荧光观察:使用荧光显微镜观察样本中的荧光信号,并通过图像分析软件进行定量分析。
应用
基因表达研究:FISH可以用来研究特定基因在细胞中的表达模式。
疾病诊断:在某些疾病中,特定RNA的表达水平会发生改变,FISH可以帮助识别这些变化。
细胞分化和发育研究:观察不同发育阶段或分化状态下的RNA分布。
微生物学:在细菌或真菌的研究中,FISH可用于鉴定特定种类的微生物。