病原微生物宏基因检测(mNGS, metagenomic Next Generation
Sequencing)是一种利用高通量测序技术对临床样本中的全部核酸进行测序,以识别其中存在的所有病原微生物的技术。与传统的微生物检测方法相比,mNGS提供了更广泛的检测范围和更高的敏感性,因为它不需要预先假设病原体的类型,也不依赖于微生物的培养。
mNGS的工作流程大致如下:
样本采集:从患者处采集相关的生物样本,如血液、脑脊液、呼吸道分泌物、粪便等。
核酸提取:从样本中提取DNA和RNA。
文库构建:将提取的核酸转化为适合测序的文库。
测序:使用高通量测序平台对文库进行测序,生成数百万至数十亿条短序列读取。
数据处理:通过生物信息学软件对测序数据进行过滤、比对和分析,识别出样本中可能存在的病原微生物。
结果解释:基于分析结果,确定潜在的病原体,并评估其致病可能性。
mNGS在病原微生物检测中的优势包括:
e测试检测:能够同时检测多种类型的病原体,包括细菌、病毒、真菌和寄生虫。
未知病原体检测:可以检测到新出现或未知的病原体,这对于应对突发传染病尤为重要。
快速响应:与传统培养方法相比,mNGS可以更快地提供诊断结果,有助于及时治疗和控制疫情。
抗药性基因检测:能够检测病原体携带的抗药性基因,指导精准用药。
然而,mNGS也存在一些挑战,比如成本较高、数据分析复杂且需要专门机构的专业人员、可能存在假阳性和假阴性结果等。尽管如此,mNGS已成为现代感染性疾病诊断中的一项重要工具,特别是在处理难治性感染和不明原因发热等复杂病例时。